MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 33376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	28894913
2	NC_004606	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	28894913
3	NC_004606	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894913
4	NC_004606	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	28894913
5	NC_004606	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
6	NC_004606	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
7	NC_004606	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	28894913
8	NC_004606	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894913
9	NC_004606	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
10	NC_004606	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894913
11	NC_004606	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	28894913
12	NC_004606	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894913
13	NC_004606	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	28894913
14	NC_004606	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894913
15	NC_004606	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	28894913
16	NC_004606	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	28894913
17	NC_004606	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
18	NC_004606	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894913
19	NC_004606	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
20	NC_004606	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894913
21	NC_004606	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
22	NC_004606	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28894913
23	NC_004606	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
24	NC_004606	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
25	NC_004606	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
26	NC_004606	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894913
27	NC_004606	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894913
28	NC_004606	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894913
29	NC_004606	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	28894913
30	NC_004606	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
31	NC_004606	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894914
32	NC_004606	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
33	NC_004606	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
34	NC_004606	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	28894914
35	NC_004606	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
36	NC_004606	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894914
37	NC_004606	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894914
38	NC_004606	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894914
39	NC_004606	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
40	NC_004606	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
41	NC_004606	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894914
42	NC_004606	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
43	NC_004606	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894914
44	NC_004606	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	28894914
45	NC_004606	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894914
46	NC_004606	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894914
47	NC_004606	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
48	NC_004606	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894914
49	NC_004606	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	28894914
50	NC_004606	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
51	NC_004606	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894914
52	NC_004606	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	28894914
53	NC_004606	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
54	NC_004606	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	28894915
55	NC_004606	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	28894915
56	NC_004606	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894915
57	NC_004606	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	28894915
58	NC_004606	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
59	NC_004606	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894916
60	NC_004606	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	28894916
61	NC_004606	A	7	7	3660	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	28894916
62	NC_004606	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	28894916
63	NC_004606	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
64	NC_004606	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	28894916
65	NC_004606	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	28894916
66	NC_004606	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894916
67	NC_004606	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894916
68	NC_004606	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	28894916
69	NC_004606	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
70	NC_004606	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
71	NC_004606	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
72	NC_004606	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
73	NC_004606	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894916
74	NC_004606	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
75	NC_004606	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894916
76	NC_004606	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894916
77	NC_004606	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
78	NC_004606	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
79	NC_004606	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
80	NC_004606	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894916
81	NC_004606	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894916
82	NC_004606	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894917
83	NC_004606	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	28894917
84	NC_004606	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894917
85	NC_004606	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894917
86	NC_004606	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894917
87	NC_004606	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894917
88	NC_004606	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894917
89	NC_004606	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894917
90	NC_004606	TTACGT	2	12	4968	4979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28894917
91	NC_004606	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894917
92	NC_004606	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894917
93	NC_004606	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894917
94	NC_004606	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894917
95	NC_004606	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	28894917
96	NC_004606	A	6	6	5206	5211	100 %	0 %	0 %	0 %	28894917
97	NC_004606	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
98	NC_004606	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894918
99	NC_004606	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
100	NC_004606	A	9	9	5379	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
101	NC_004606	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
102	NC_004606	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
103	NC_004606	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
104	NC_004606	T	6	6	5819	5824	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
105	NC_004606	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
106	NC_004606	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894918
107	NC_004606	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
108	NC_004606	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
109	NC_004606	A	6	6	5993	5998	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
110	NC_004606	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
111	NC_004606	A	6	6	6028	6033	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
112	NC_004606	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
113	NC_004606	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
114	NC_004606	T	6	6	6128	6133	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
115	NC_004606	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
116	NC_004606	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	28894918
117	NC_004606	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
118	NC_004606	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894918
119	NC_004606	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894918
120	NC_004606	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	28894918
121	NC_004606	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
122	NC_004606	A	7	7	6414	6420	100 %	0 %	0 %	0 %	28894918
123	NC_004606	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894918
124	NC_004606	ACGA	2	8	6462	6469	50 %	0 %	25 %	25 %	28894918
125	NC_004606	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	28894918
126	NC_004606	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	28894918
127	NC_004606	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
128	NC_004606	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894918
129	NC_004606	GATTCA	2	12	6763	6774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28894918
130	NC_004606	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
131	NC_004606	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894918
132	NC_004606	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894918
133	NC_004606	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
134	NC_004606	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
135	NC_004606	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
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137	NC_004606	GAT	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
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